多肽一级结构，二级结构鉴定是多肽分析鉴定的关键方法，多肽一级结构有氨基酸组成分析，质谱分析，氨基酸序列分析。二级结构包含：X-衍射，NMR，圆二色谱（CD）等。以下是合成多肽二级结构的分析鉴定和纯度分析。

　　二维、三维以及四维NMR伴随分子生物学、计算机处理技术的发展而取得应用，这致使NMR逐步变为大分子结构物质分析的主要方法之一。NMR能够用确定来氨基酸序列、分布以及构象。到现在为止，NMR能够十分精确且快速地取得分析结果，这对分子中不超郭30个氨基酸的小肽的有非常大的分析作用。

　　要想获得生物大分子的二级结构，圆二色谱需对蛋白质等生物大分子的圆二色光谱进行测量，其快捷，简单，在酶动力学，蛋白质构象研究，蛋白质折叠等方面获得广泛的使用。是一种特殊的吸收谱。

　　肽链为圆二色谱紫外区间的主要生色团，这一波长范围的CD谱中含有生物大分子主链构象的数据。在220nm附近无规则卷曲构象的CD谱有一小而宽的正峰，198nm附近有一负峰；α-螺旋构象的CD谱在190nm附近有一正峰，在222nm、208nm处有一负峰。β-折叠构象的CD谱在195-198nm处有一强的正峰，在217-218nm处有一负峰。

　　多肽的纯度分析往往都会使用HPLC办法，选取洗脱梯度，5%B--65%B，时长30min，RP-C18，颗粒直径5μm，孔径300A，4.6×150mm，流动相：A，0.1%TFA/H2O；B，0.1%TFA/ACN。有一部分短肽鉴于具有很强的亲水性，在C18上保留比较弱，就需要对条件进行调整，具体的办法有以下两种：

　　杭州固拓生物科技有限公司定制多肽合成业务:药物肽、临床肽、订书肽、淀粉肽、醛肽、环肽、二硫键搭桥多肽、穿膜肽、各种抗菌肽、美容肽、磷酸化肽、PEG肽、偶联BSA和KLH抗原肽、各类酸修饰多肽、各种胺类化合物修饰多肽(苯胺、异戊胺、二乙胺)、各类荣光标记(FITC、FAM系列、DOTA、TAMRA系列、Cy系列)同位素肽等。